روش های کنترل تری هالومتان ها بسیار حائز اهمیت است. به منظور کنترل مقدار تری هالومتان ها به ترتیب مراحل زیر را باید مدنظر قرار داد.
باید سایر منابع آب آشامیدنی محلی نظیر آب زیرزمینی مورد مطالعه قرار گیرند. چنانچه منبع مناسب پیدا نشد یا اقتصادی نبود مرحله دوم باید مورد بررسی قرار گیرد.
این مرحله شامل چندین گزینه می باشد که همان بهبود و اطلاح تکنیک تصفیه متداول می باشد.
اگر هر یک از دو مرحله فوق قادر به رفع مشکل تری هالومتان ها نباشد، باید از آزمایش پایلوت برای تعیین بهترین گزینه استفاده کنیم و هزینه های مورد نظر را بدست آوریم. در صورتیکه هر یک از گزینه های مرحله دوم قابل کاربرد نباشد، باید از روش های موثر و گران قیمت بعدی ( مرحله سوم ) استفاده کنیم.
گزینه های این مرحله عبارتند از: